|
|
@@ -1 +1,75 @@
|
|
|
-Roman K. was here
|
|
|
+<p align="center">
|
|
|
+ <h1 align="center">PULSEQ INTERPRETATOR</h1>
|
|
|
+</p>
|
|
|
+
|
|
|
+## Quick Links
|
|
|
+
|
|
|
+> - [ Обзор/Overview](#-overview)
|
|
|
+> - [ Особенности/Features](#-features)
|
|
|
+> - [ Подготовка / Getting Started](#-getting-started)
|
|
|
+> - [ Установка/Installation](#-installation)
|
|
|
+
|
|
|
+
|
|
|
+---
|
|
|
+
|
|
|
+## Обзор/Overview
|
|
|
+
|
|
|
+Алгоритм для обработки специальных .seq файлов, содержащих импульсные последовательности, предназначен для создания последовательностей синхронизирующих импульсов для использования в аппарате магнитно-резонансной томографии (МРТ).
|
|
|
+
|
|
|
+---
|
|
|
+Algorithm for processing special .seq files containing pulse sequences is designed for creating sequences of synchronizing pulses for use in magnetic resonance imaging (MRI) devices.
|
|
|
+
|
|
|
+---
|
|
|
+
|
|
|
+## Особенности/Features
|
|
|
+
|
|
|
+1. Чтение .seq файла и извлечение информации о параметрах импульсов, таких как длительность, амплитуда, временные интервалы между импульсами и т.д.
|
|
|
+2. Анализ полученных данных для определения оптимальной последовательности импульсов, обеспечивающей необходимую синхронизацию для проведения МРТ исследования.
|
|
|
+3. Генерация нового файла с последовательностью синхронизирующих импульсов на основе анализа и оптимизации параметров.
|
|
|
+4. Проверка сгенерированной последовательности на соответствие требованиям аппарата МРТ и корректировка при необходимости.
|
|
|
+5. Экспорт окончательной последовательности импульсов для использования в работе с аппаратом МРТ.
|
|
|
+---
|
|
|
+1. Reading the .seq file and extracting information about pulse parameters, such as duration, amplitude, time intervals between pulses, etc.
|
|
|
+2. Analyzing the obtained data to determine the optimal pulse sequence that ensures the necessary synchronization for conducting MRI research.
|
|
|
+3. Generating a new file with the synchronizing pulse sequence based on the analysis and optimization of parameters.
|
|
|
+4. Checking the generated sequence for compliance with the requirements of the MRI device and adjusting it if necessary.
|
|
|
+5. Exporting the final pulse sequence for use in working with the MRI device.
|
|
|
+
|
|
|
+---
|
|
|
+
|
|
|
+
|
|
|
+## Подготовка / Getting Started
|
|
|
+
|
|
|
+***Требования/Requirements***
|
|
|
+
|
|
|
+chartio==6.0.1
|
|
|
+
|
|
|
+matplotlib==3.8.4
|
|
|
+
|
|
|
+numpy==1.26.4
|
|
|
+
|
|
|
+pypulseq==1.4.0
|
|
|
+
|
|
|
+
|
|
|
+### Установка/Installation
|
|
|
+
|
|
|
+1. Клонируйте репозиторий/Clone the repository:
|
|
|
+
|
|
|
+```sh
|
|
|
+git clone https://git.physics.itmo.ru/cp.lab/MRI.git
|
|
|
+```
|
|
|
+
|
|
|
+2. Перейдите в директорию проекта/Change to the project directory:
|
|
|
+
|
|
|
+```sh
|
|
|
+cd cplab_copy
|
|
|
+```
|
|
|
+
|
|
|
+3. Установите требуемые пакеты/Install the required packages:
|
|
|
+
|
|
|
+```sh
|
|
|
+> pip install numpy==1.26.4
|
|
|
+> pip install matplotlib==3.8.4
|
|
|
+> pip install pypulseq==1.4.0
|
|
|
+```
|
|
|
+
|
Roman Kozin